【液体活检干货分享】全式金磁珠法高效提取游离DNA

2021/05/20 835

游离DNA是一种存在于动植物和人的体液中的细胞外游离状态的DNA,血中游离DNA又称循环核酸(circulating nucleic acid),是指循环血中游离于细胞外的部分降解了的机体内源性DNA。1948年首次报道外周血中存在cfDNA,1994年从肿瘤患者外周血中检出RAS基因片段,cfDNA开始被人们重视。目前已经在血浆、血清、尿液、前列腺液、支气管灌洗液、唾液、脑脊液、胃液、胆汁、淋巴液、腹腔液及粪便中检测到了游离循环核酸。


在特定情况下(如肿瘤患者,孕妇,接受器官移植的患者等),一小部分来自"异源性"细胞的cfDNA(如肿瘤细胞,胎儿细胞或供体细胞)可以作为基因检测的标志物。随着精准医疗时代技术的发展,越来越多的研究者和医生将基于cfDNA检测的"液态活检"技术应用于产前诊断,肿瘤的筛查,早期诊断,治疗监测和预后评估等多个方面,将其作为补充或替代组织活检的新方法。


高效的cfDNA的提取和检测对于下一步应用至关重要。游离DNA的检测技术有新一代测序(NGS)、数字PCR、ARMS-PCR、核酸质谱等。目前游离DNA分析的主要障碍之一在于无法有效获取血液中微量的cfDNA,收集操作困难,丢失量大,检验灵敏度低。目前,cfDNA主要的提取方法有硅胶柱法、酚-氯仿法和磁珠分离法等。


为克服传统提取方法的提取效率低,重复性差,抑制物残留多等缺点,全式金最新推出磁珠法cfDNA提取试剂盒(MagicPure® Cell-Free DNA Kit II 目录号EC211),该试剂盒操作简便,最大程度结合血浆cfDNA,去除杂质,使提取得到的血浆cfDNA中无大片度残留,且具有更高的纯度,尤其适合于小片段DNA的提取,在下游文库构建实验中具有更高的文库构建效率,更高的测序数据质量,更高的准确性。该试剂盒及提取方法已申请专利(专利名称一种提取血浆游离DNA的试剂盒和方法)。



实验数据


提取效果展示

TransGen 提取的cfDNA 主片段浓度(Agilent 检测)均高于Company Q。


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TransGen提取的cfDNA主片段大小小于Company Q,对90-150 bp的覆盖度要高于Company Q,有助于提高ctDNA的检出率,更好的应用于肿瘤研究。


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文库构建分析

使用TransGen 和Company Q提取的cfDNA进行测序文库构建,在同样的PCR循环数下,TransGen提取的cfDNA进行后续文库扩增效率更高。


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会议简介


由万怡医学主办的第六届全球精准医疗(中国)峰会将于2021年6月4-5日广州融创万达嘉华酒店召开。大会历时两日,同期举办第六届基因检测和体外诊断大会、第三届肿瘤免疫治疗领袖峰会,规模再次扩大,盛邀您6月相聚广州,共襄盛会!

大会信息


大会日期:2021年6月4-5日


大会地点:广州融创万达嘉华酒店


会议规模:1200+人


主办单位:万怡医学


支持单位:

全国卫生产业企业管理协会转化医学产业分会

武汉东湖国家自主创新示范区生物医药行业协会

深圳市生物医药促进会

广州市生物产业联盟

全国创新生物医药创业投资服务联盟

广东医谷

广东省保健协会检验分会

新药创始人俱乐部

华大智造

深圳国家基因库


大会亮点:100+ 权威讲者

1200+ 参会代表

80+ 厂商展演

100+ 媒体曝光机会


会议官网:www.wpmcs.com.cn


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END

大会联系人 | 王女士

电话 | 17701745462

邮箱 | lynwang@healife.com


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